西安碑林博物馆的历史可以追溯到遥远的古代，但其作为博物馆的正式设立和发展则经历了一系列的历史变迁。
最初，这里被称为“碑院”，自明万历年间开始有“碑林”的称谓。到了清乾隆三十七年（1772年），陕西巡抚毕沅重新规划和改建了碑林建筑，对藏石进行了整理，分类陈列，并建立了相应的管理制度。近代最大的一次整修发生在民国26～27年（1937～1938年），由当时的中央古物保管委员会联合陕西省政府组成“整理西安碑林工程监修委员会”负责实施，考古学家黄文弼主持了这次整修。这次整修建成了陈列室8所、卷棚2所、碑廊6所以及其他辅助建筑，基本形成了今日碑林的建筑格局。
民国三十三年（1944年），陕西省历史博物馆在碑林成立。1953年，孔庙被扩充为陕西省历史博物馆馆区。然而，随着博物馆事业的发展，1991年陕西历史博物馆新馆正式开放，碑林从省博物馆中拆分出来，成为一座独立的博物馆——西安碑林博物馆。
此外，西安碑林博物馆的建立与一些重要的历史事件和人物也密切相关。例如，唐天宝四年（745年），唐玄宗李隆基曾亲自作序、注解并以隶书书写的《孝经》刻石，即《石台孝经》，就是该馆的重要藏品之一。此外，唐开成二年（837年）刻成的《开成石经》也是该馆的重要展品，它包括了《周易》、《尚书》、《诗经》等12种儒家经典及五经文字、九经字样，是研究中国古代文化的重要资料。
西安碑林博物馆不仅是一座收藏和研究历代碑石、墓志及石刻造像的专题性博物馆，更是传承和弘扬中华文化的重要场所。它见证了中华文化的悠久历史和辉煌成就，为后人留下了宝贵的精神财富。
